La coordinación y el liderazgo es fundamental si lo que pretendemos es lograr objetivos que favorezcan una real integración del inmigrante en España, siendo a su vez co-responsables con su país de origen. En este sentido la Secretaría General es la encargada de lograr a través de sinergias, que todas las Áreas de trabajo de la FEIN formen parte de un todo. Conjuntamente con Presidencia elabora los principales lineamientos de actuación de la Federación.